一个新的执行机构——农业部下设的“欧洲农业基金认证审计署”——将负责为农民认证欧盟补贴。预计这一未来农业架构中的公务员编制为22人。
在农业部之下设立一个新的监管机构，负责审计来自农业基金的欧洲资金，这目前仍是一份部长会议的法令草案，已由农业部公布以征求公众意见。众所周知，迄今为止，农业部门都是根据《公共采购法》通过招标来选择审计机构，这造成了巨大压力，通常伴随着欧洲资金未能及时吸收，以及公共丑闻，甚至常常诉诸法庭裁决。事实是，为国家基金农业旗下的支付机构寻找认证机构的招标，已经不止一次，而是多次失败了。因此，创建一个将扮演财务报告控制环节的执行机构，对于农业部门资金的高质量分配是必要的一步。
根据欧洲规则，审计欧盟农业基金的认证机构可以是公共的或私人的，由成员国指定。当其为私人审计机构时，需通过公开招标程序进行选择。新机构将基于对国家基金农业旗下支付机构年度财务报告的审核出具意见，欧洲委员会将据此拨付欧盟补贴。
